4, 6-二芳基-2-氨基嘧啶类衍生物的合成与生物活性

合成并表征了5种4,6-二芳基-2-氨基嘧啶类化合物。 测试了它们对大肠肝菌甲硫酰胺肽酶(EcMetAP)的抑制作用及对CXCR4受体的拮抗作用。 发现5种化合物均对EcMetAP酶活有抑制作用,除化合物2外均对CXCR4受体有拮抗作用。 利用FieldTemplater和FieldAlign软件对化合物1～5的上述活性构效关系进行了分析,初步认为化合物的嘧啶环3位N原子及4位取代苯环上若引入给电子基团,可增强这类化合物的EcMetAP酶抑制活性;在嘧啶环2位引入负电性较强的基团取代,改造2个苯环和嘧啶环的4、5、6位Ｃ原子的结构可增强其CXCR4受体拮抗活性。     

基于粒子群优化算法的神经网络在农药定量构效关系建模中的应用

神经网络模型能有效模拟非线性输入输出关系,但其常规训练算法为BP或其它梯度算法,导致训练时间较长且易陷入局部极小点。本实验探讨用粒子群优化算法训练神经网络,并应用到苯乙酰胺类农药的定量构效关系建模中,对未知化合物的活性进行预测来指导新药的设计和合成。仿真结果表明,粒子群优化算法训练的神经网络不仅收敛速度明显加快,而且其预报精度也得到了较大的提高。     

基于配体与受体结构的酪氨酸酶抑制剂定量构效关系分析

酪氨酸酶是细胞内催化合成黑素的关键酶。 理解酪氨酸酶抑制剂结构与活性之间的关系对于设计新药和化妆品具有重要意义。 然而,酪氨酸酶抑制剂的定量构效关系仍不清楚。 本文利用配体和结构描述符构建了隐式和显式模型,阐明了酪氨酸酶抑制剂定量构效关系。 隐式模型的相关系数R高达0.961,显式模型的相关系数为0.775。 两个模型很好地预测了3个茶多酚的酪氨酸酶抑制活性,表儿茶素没食子酸酯(ECG)>表没食子儿茶素没食子酸酯(EGCG)>没食子酸(G)。 相关性分析发现,抑制剂与酪氨酸酶结合引起的构象熵损失与抑制剂的活性密切相关。 具有较少构象熵损失的ECG在4种茶多酚中具有较高酪氨酸酶抑制活性。 结合自由能计算也证实ECG与酪氨酸酶的结合能力最强。 此外,通过分解结合自由能发现,酪氨酸酶活性中心的氨基酸残基(His57、His201、Asn202、His205、Glu192和Val215)与抑制剂形成了较强的范德华和静电相互作用,进而稳定了复合物结构。     

Design, syntheses and biological activity of novel ALS inhibitors (IX)

Quantitative structure-activity relationships for herbicidal activity against rape of sulfonylurea and triazolopyrimidine-2-sulfonamide derivatives were examined three-dimensionally using comparative molecular field analysis (CoMFA). The CoMFA results show that the slopes in steric and electrostatic fields around the molecule were significant for both series in governing the potency variations in herbicidal activity. Based upon the successful superposition between the two series, the herbicidal activity was analyzable with a single equation for the combined set of compounds, which suggested that the two different series of compounds have a common region of the receptor site. Project supported by the National Natural Science Foundation of China (Grant No. 29832050), the Special Key Fund of Natural Science of Tianjin (Grant No. 983801011) and the Doctoral Fund of the Education Ministry of China.     

循环子空间回归的一种快速算法及其在定量构效关系中的应用

循环子空间回归（ＣＳＲ）通过改变解空间的维数,可以获取一系列的回归模型,其中包括最小二乘回归（ＬＳＲ）、主成分回归（ＰＣＲ）、偏最小二乘回归（ＰＬＳＲ）和许多中间回归,从中可挑选最优回归模型。本文将分析ＣＳＲ的原理,给出一种可行的快速的ＣＳＲ算法（ＲＣＳＲ）,以提高计算速率和精度,并将其成功地应用于苯乙酰胺类除草剂定量构效关系的建模。     

高效液相色谱法测定双哌嗪双季铵盐药物的分配系数及对构效关系的考察

采用高效液相色谱法测定了１０种新合成的双哌嗪双季铵盐药物的油－水分配系数,并对其毒性及生物活性进行了测试。讨论了分配系数、毒性、活性及分子结构间的关系,找出了２个理想的先导药物。     

五元杂环并嘧啶类胸苷酸合成酶抑制剂的构效关系和分子对接

用比较分子场分析法(CoMFA)和比较分子相似性指数分析法(CoMSIA)研究了38个五元杂环并嘧啶衍生物类胸苷酸合成酶抑制剂的三维定量构效关系(3D-QSAR), 建立了相关预测模型. CoMFA和CoMSIA模型的交互验证相关系数q²分别为0.662和0.672、非交互验证相关系数R²分别为0.921和0.884、外部交互验证相关系数Q_ext²分别为0.85和0.81. 分子对接得到的结合模式与三维定量构效关系得到的结果一致. 结果表明这两种模型都具有良好的预测能力, 可应用于指导化合物的设计和结构修饰, 为进一步设计新型胸苷酸合成酶抑制剂提供了理论依据.     

Al-MOF基多级孔Al2O3固定化酶反应器的构筑及构效关系研究

针对生物酶在固相载体负载后存在的催化活性与稳定性之间“此消彼长”的问题, 本工作采用“自牺牲模板”策略以铝基金属有机骨架材料(Al-MOF)为前驱体设计制备多级孔Al₂O₃ (MHAl₂O₃)材料, 再以“聚多巴胺(PDA)”仿生膜对材料表面进行功能化修饰后用以固载辣根过氧化物酶(HRP). 通过调节前驱体的煅烧温度来实现载体孔径大小的调控, 探讨了载体的孔道限域效应对固定化酶反应器催化活性的影响, 所得固定化酶反应器的热稳定性和重复使用性显著提高. 为了解析固定化酶反应器的构效关系, 采用酶动力学和热动力学参数研究了固定化酶反应器催化过程中酶与底物的相互作用, 结果表明固载后酶分子对底物的亲和性和专一性得到提升. 将固定化酶反应器用于模拟废水中苯胺黑药的催化降解时, 表现出非常高效的催化效率.     

三苯胺类染料敏化太阳能电池能量转化效率的全息定量构效关系研究

研究构建了三苯胺类化合物分子结构与相应染料敏化太阳能电池能量转化效率(PCE)之间的全息定量构效关系(HQSAR)模型。当fragment distinction、fragment size、hologram length和principal components分别为“C、DA”、“4-7”、“199”和“6”时,可以获得最优HQSAR模型。采用外部测试集验证和留一交叉验证对所建立模型进行检验,外部测试集验证中CCC和 Q2F3分别为0.933和0.892,留一交叉验证中其q2cv和r2分别为0.791和0.902,表明所建立模型具有较好的拟合效果和预测能力。通过所建立HQSAR模型的分子贡献图可知,环戊并二噻吩基团的存在有利于提高PCE值,长烷基链的存在可能降低PCE值。     

Synthesis of Rhodomyrtone Analogs Modified at C7

We developed a route to rhodomyrtone analogs that feature different acyl groups at C7. Since electrophilic substitution reactions on the aryl part of the rhodomyrtone core led to C5 derivatives, the C5 position was blocked by a chlorine. Subsequent Duff type formylation followed by Grignard addition to the aldehyde group and oxidation gave various phenones. The benzyl protecting groups were removed by hydrogenation or boron tribromide. Some derivatives turned out to be quite active against multiple resistant Staphylococcus aureus strains and a rhodomyrtone resistant mutant (Rom^R). The chlorine at C5 seems to have a beneficial effect on the antibacterial activity.